螺桿空壓機的出口管路設有止回閥，高溫高壓的濕空氣通過螺桿空壓機排氣閥排出，經過后級冷卻器后仍夾帶一定的油、水成分。雖然螺桿空壓機的二、三級級間冷卻器和末級冷卻器后均配有氣水分離器，用于分離壓縮過程中產生的水分，但實際的運行效果并不理想。由于螺桿空壓機停備時間長，排氣產生的水分聚集在管路及止回閥周圍，導致水分回流至機箱內部，潤滑油含水量逐漸增多，最終導致高壓螺桿空壓機油位報警并故障停機。在停機拆除螺桿空壓機的出口管路時，發現管內有大量的乳白色液體流出，這說明螺桿空壓機的排氣含水量嚴重超標。
根據螺桿空壓機的運行要求，螺桿空壓機應設有最低運行時間，以防止形成冷凝水，因為冷凝水會引起氣缸閥片、機架部件等的生銹。冷凝水在曲軸箱中的聚積可能會造成油位讀數出錯。水和油無法混合，它們的共同存在造成油快速變質。最低運行時間一般不少于10min，應足以使得螺桿空壓機加熱到氣化凝結的潮氣。
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